All
Chemical Reagents
Biomedicine
Organic raw materials
Inorganic chemical industry
intermediate
Agricultural chemicals
Auxiliaries and catalysts
Fragrances and Flavors
Dyes and Pigments
Daily chemical industry

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo

CAS number:unknown    molecular formula:

overview

compound introduction

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo是阿拉丁自行研发的用于方便地插入靶向目的基因的sgRNA (Single guide RNA)并使用CRISPR/Cas9基因编辑(Gene editing)系统进行基因编辑的质粒。本质粒表达绿色荧光蛋白EGFP (Enhanced green fluorescent protein)便于观察转染效率或感染效果,同时携带了Neo抗性(G418抗性),方便后续进行多克隆或单克隆稳定细胞株的筛选。本质粒在插入靶向目的基因的sgRNA后,可以直接转染细胞进行基因编辑,也可以用于包装慢病毒后感染细胞或组织进行基因编辑。慢病毒(Lentivirus)是以HIV-1 (人类免疫缺陷1型病毒)为基础发展起来的病毒载体系统。它能高效地将目的基因(蛋白质编码序列或小RNA)导入动物或人的原代细胞或细胞系。慢病毒的宿主范围广,对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力,可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达,被广泛应用到各种细胞系的基因过表达、RNA干扰、microRNA研究以及活体动物实验中1-3]。本慢病毒载体进行了多方面的改造,删除了慢病毒绝大部分的致病基因,并使包装后的病毒失去了自我复制能力,安全性大大提升,并能有效提高外源基因的表达效果。本质粒可以和pCMV-VSV-G 以及pCAG-dR8.9 配合使用进行慢病毒的包装。本质粒经过BsmBⅠ (CGTCTC(1/5)^)限制性核酸内切酶消化后,切除图谱中标示的filler,把设计好的靶向特定基因的sgRNA序列经退火后形成的双链寡核苷酸片段连接到载体中,就能构建成相应的用于基因编辑的质粒了。本质粒中使用了人源化脓性链球菌Cas9 (Humanized S. pyogenes Cas9, hSpCas9)。hSpCas9是一种能在sgRNA的引导下切割双链DNA的核酸内切酶。在sgRNA的引导下,Cas9剪切基因靶位点产生双链DNA断裂,随后在细胞DNA修复过程中会导致基因靶位点处的插入、删除或替换,从而可能产生移码突变,导致目的基因的缺失突变。当设计的sgRNA的基因靶位点相对比较靠近5'端的时候,就能导致通常所说的基因敲除。本质粒中在hSpCas9的C端添加了核定位信号(Nuclear localization signal, NLS),能够有效确保hSpCas9定位在细胞核,从而有效提高基因编辑效率。本质粒表达的Cas9带有Flag标签,可通过Flag抗体检测Cas9的表达。同时本质粒中Cas9-Flag和EGFP之间通过P2A连接。EGFP与Cas9-Flag同时翻译,可以呈现很强的绿色荧光,可以在荧光显微镜下非常便捷地观察到本质粒的表达情况(图1),并且也方便使用流式细胞仪分选阳性细胞。P2A是一个可以被理解为含有19个氨基酸残基(ATNFSLLKQAGDVEENPGP)的“自剪切”小肽。但实际的过程并不是发生自剪切,而是使核糖体跳过P2A等2A元件C端的甘氨酸和脯氨酸肽键的合成而发挥作用,最终导致2A序列末端和下游产物分离。上游Cas-Flag的C端将会添加一些额外的P2A残基,而下游蛋白的N端将会有额外的脯氨酸。在P2A肽的N端加入GSG序列,可提高剪切效率。图1.阿拉丁pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo质粒使用UltraBio™8000转染试剂转染293T细胞后的表达效果图。左侧为明场照片,右侧为荧光照片。本质粒含有卡那霉素(Kanamycin)和新霉素(Neomycin)抗性。在大肠杆菌中呈现卡那霉素抗性。本质粒转染哺乳动物细胞后,可使用G418 筛选多克隆或单克隆细胞株。pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo质粒的主要信息如下:pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo质粒(14484bp)的图谱如下:pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo的详细图谱见说明书:https://www.aladdin-e.compLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo中没有的酶切位点包括:pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo中的单酶切位点包括:pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo质粒可使用的测序引物序列如下:sgRNA的测序引物hU6-F primer: 5'-GAGGGCCTATTTCCCATGATT-3'pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo的全序列信息:D8301 pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo序列.txt 注意事项 : 本质粒未经阿拉丁书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。 使用说明 : 1.首次使用1µg包装的本产品时,请先取少量本质粒转化大肠杆菌,进行质粒小量、中量或大量抽提后再用于后续用途。抽提获得的质粒可以通过酶切电泳进行鉴定,或通过测序进行鉴定。2.100µg包装的本产品质粒浓度为0.1µg/µl,共1ml。可以直接用于酶切或者转染细胞。3.本质粒构建方案如下,仅供参考。a.质粒酶切和去磷酸化。 Reagent Volume pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-EGFP-Neo xμl (1-2μg) FastDigest BsmBI 1μl 转染试剂转染细胞。构建好的质粒后续也可以和pCMV-VSV-G 以及pCAG-dR8.9 配合使用进行慢病毒的包装。参考文献:1.Mautino MR. Curr Gene Ther. 2002. 2(1):23-43.2.Sumimoto H, Kawakami Y. Future Oncol. 2007. 3(6):655-664.3.Stripecke R, Koya RC, Ta HQ, Kasahara N, Levine AM. Blood Cells Mol Dis. 2003. 31(1):28-37.

Specs

Chinese alias-
English alias-
CAS numberunknownmolecular formula
molecular weight-Exact mass-
PSA-logp-

numbering system

No numbering system information yet

physicochemical properties

No physical and chemical property information yet

Safety information

No safety information yet

Production methods and uses

No production method and use information yet

Related

upstream information

No upstream information yet

downstream information

No downstream information yet

MSDS

Found 0 shareMSDS